Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TLR1Q15399 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms