Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRKQ15262 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms