Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDGFRLQ15198 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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