Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
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