Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FHL3Q13643 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms