Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
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CUL4AQ13619 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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CUL4AQ13619 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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CUL4AQ13619 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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CUL4AQ13619 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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CUL4AQ13619 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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CUL4AQ13619 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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CUL4AQ13619 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL4AQ13619 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
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