Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CUL1Q13616 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms