Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
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PEX6Q13608 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PEX6Q13608 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PEX6Q13608 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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