Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms