Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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