Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE3BQ13370 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE3BQ13370 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
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