Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM28Q13263 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRIM28Q13263 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRIM28Q13263 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRIM28Q13263 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRIM28Q13263 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRIM28Q13263 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRIM28Q13263 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM28Q13263 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM28Q13263 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM28Q13263 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM28Q13263 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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