Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF6Q13247 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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