Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNMA1Q12791 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms