Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KRTAP1-1Q07627 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms