Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms