Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms