Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREMQ03060 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREMQ03060 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREMQ03060 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREMQ03060 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREMQ03060 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREMQ03060 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CREMQ03060 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREMQ03060 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREMQ03060 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREMQ03060 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREMQ03060 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREMQ03060 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREMQ03060 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREMQ03060 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREMQ03060 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CREMQ03060 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREMQ03060 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREMQ03060 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREMQ03060 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREMQ03060 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREMQ03060 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREMQ03060 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREMQ03060 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREMQ03060 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREMQ03060 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREMQ03060 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREMQ03060 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CREMQ03060 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CREMQ03060 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREMQ03060 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREMQ03060 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREMQ03060 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREMQ03060 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CREMQ03060 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CREMQ03060 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREMQ03060 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREMQ03060 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREMQ03060 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREMQ03060 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREMQ03060 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CREMQ03060 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREMQ03060 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREMQ03060 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREMQ03060 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREMQ03060 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREMQ03060 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREMQ03060 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREMQ03060 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREMQ03060 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREMQ03060 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREMQ03060 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREMQ03060 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREMQ03060 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREMQ03060 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREMQ03060 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREMQ03060 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREMQ03060 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREMQ03060 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREMQ03060 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREMQ03060 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREMQ03060 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREMQ03060 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREMQ03060 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CREMQ03060 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREMQ03060 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREMQ03060 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREMQ03060 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREMQ03060 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREMQ03060 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CREMQ03060 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREMQ03060 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREMQ03060 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREMQ03060 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREMQ03060 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREMQ03060 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREMQ03060 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREMQ03060 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREMQ03060 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREMQ03060 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREMQ03060 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREMQ03060 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREMQ03060 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREMQ03060 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREMQ03060 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREMQ03060 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREMQ03060 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CREMQ03060 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREMQ03060 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREMQ03060 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREMQ03060 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREMQ03060 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREMQ03060 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CREMQ03060 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREMQ03060 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREMQ03060 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREMQ03060 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREMQ03060 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREMQ03060 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREMQ03060 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms