Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms