Protein–RNA interactions for Protein: P61923

COPZ1, Coatomer subunit zeta-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ1P61923 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPZ1P61923 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms