Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms