Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms