Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms