Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP9P55211 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP9P55211 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP9P55211 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP9P55211 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP9P55211 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP9P55211 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP9P55211 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP9P55211 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP9P55211 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP9P55211 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP9P55211 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP9P55211 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP9P55211 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP9P55211 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP9P55211 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP9P55211 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP9P55211 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP9P55211 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP9P55211 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP9P55211 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP9P55211 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP9P55211 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP9P55211 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP9P55211 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP9P55211 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP9P55211 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP9P55211 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP9P55211 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP9P55211 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP9P55211 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP9P55211 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP9P55211 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP9P55211 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP9P55211 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP9P55211 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP9P55211 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP9P55211 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP9P55211 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP9P55211 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP9P55211 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP9P55211 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP9P55211 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP9P55211 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP9P55211 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP9P55211 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP9P55211 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP9P55211 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP9P55211 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP9P55211 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP9P55211 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP9P55211 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP9P55211 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP9P55211 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP9P55211 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP9P55211 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP9P55211 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP9P55211 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP9P55211 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP9P55211 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP9P55211 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP9P55211 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP9P55211 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP9P55211 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP9P55211 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP9P55211 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP9P55211 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP9P55211 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP9P55211 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP9P55211 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP9P55211 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP9P55211 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP9P55211 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP9P55211 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP9P55211 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP9P55211 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP9P55211 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP9P55211 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP9P55211 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP9P55211 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP9P55211 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP9P55211 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP9P55211 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP9P55211 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP9P55211 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP9P55211 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP9P55211 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP9P55211 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP9P55211 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP9P55211 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP9P55211 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP9P55211 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP9P55211 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP9P55211 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP9P55211 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP9P55211 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP9P55211 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP9P55211 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP9P55211 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP9P55211 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms