Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms