Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms