Protein–RNA interactions for Protein: P48764

SLC9A3, Sodium/hydrogen exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3P48764 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms