Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KDM5CP41229 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms