Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGAEP38570 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms