Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 309.7 ms