Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms