Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
THBS4P35443 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
THBS4P35443 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
THBS4P35443 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
THBS4P35443 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
THBS4P35443 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
THBS4P35443 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
THBS4P35443 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
THBS4P35443 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
THBS4P35443 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
THBS4P35443 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
THBS4P35443 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
THBS4P35443 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
THBS4P35443 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
THBS4P35443 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
THBS4P35443 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
THBS4P35443 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
THBS4P35443 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
THBS4P35443 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
THBS4P35443 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
THBS4P35443 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
THBS4P35443 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
THBS4P35443 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
THBS4P35443 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
THBS4P35443 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
THBS4P35443 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
THBS4P35443 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
THBS4P35443 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
THBS4P35443 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
THBS4P35443 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
THBS4P35443 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
THBS4P35443 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
THBS4P35443 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
THBS4P35443 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
THBS4P35443 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
THBS4P35443 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
THBS4P35443 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
THBS4P35443 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
THBS4P35443 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
THBS4P35443 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
THBS4P35443 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
THBS4P35443 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
THBS4P35443 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
THBS4P35443 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
THBS4P35443 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
THBS4P35443 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
THBS4P35443 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
THBS4P35443 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
THBS4P35443 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
THBS4P35443 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
THBS4P35443 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
THBS4P35443 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
THBS4P35443 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
THBS4P35443 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
THBS4P35443 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
THBS4P35443 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
THBS4P35443 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
THBS4P35443 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
THBS4P35443 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
THBS4P35443 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
THBS4P35443 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
THBS4P35443 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
THBS4P35443 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
THBS4P35443 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
THBS4P35443 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
THBS4P35443 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
THBS4P35443 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
THBS4P35443 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
THBS4P35443 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
THBS4P35443 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
THBS4P35443 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
THBS4P35443 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
THBS4P35443 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
THBS4P35443 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
THBS4P35443 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
THBS4P35443 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
THBS4P35443 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
THBS4P35443 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
THBS4P35443 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
THBS4P35443 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
THBS4P35443 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
THBS4P35443 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
THBS4P35443 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
THBS4P35443 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
THBS4P35443 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
THBS4P35443 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
THBS4P35443 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
THBS4P35443 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
THBS4P35443 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THBS4P35443 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
THBS4P35443 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THBS4P35443 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THBS4P35443 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THBS4P35443 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THBS4P35443 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THBS4P35443 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THBS4P35443 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THBS4P35443 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THBS4P35443 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THBS4P35443 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms