Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC12P31275 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms