Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA9P31269 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms