Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA7P31268 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms