Protein–RNA interactions for Protein: P29353

SHC1, SHC-transforming protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC1P29353 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHC1P29353 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHC1P29353 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SHC1P29353 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHC1P29353 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SHC1P29353 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHC1P29353 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SHC1P29353 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHC1P29353 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHC1P29353 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHC1P29353 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHC1P29353 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHC1P29353 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHC1P29353 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHC1P29353 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHC1P29353 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHC1P29353 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHC1P29353 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHC1P29353 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHC1P29353 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHC1P29353 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHC1P29353 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHC1P29353 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHC1P29353 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHC1P29353 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHC1P29353 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHC1P29353 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHC1P29353 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHC1P29353 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHC1P29353 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHC1P29353 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHC1P29353 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHC1P29353 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHC1P29353 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHC1P29353 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHC1P29353 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHC1P29353 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHC1P29353 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SHC1P29353 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SHC1P29353 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SHC1P29353 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHC1P29353 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHC1P29353 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHC1P29353 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHC1P29353 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHC1P29353 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHC1P29353 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHC1P29353 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHC1P29353 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHC1P29353 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHC1P29353 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHC1P29353 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SHC1P29353 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHC1P29353 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHC1P29353 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHC1P29353 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHC1P29353 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHC1P29353 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHC1P29353 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHC1P29353 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHC1P29353 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHC1P29353 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHC1P29353 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHC1P29353 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHC1P29353 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHC1P29353 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHC1P29353 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHC1P29353 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHC1P29353 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHC1P29353 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHC1P29353 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHC1P29353 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHC1P29353 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHC1P29353 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHC1P29353 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHC1P29353 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHC1P29353 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHC1P29353 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHC1P29353 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHC1P29353 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHC1P29353 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHC1P29353 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHC1P29353 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SHC1P29353 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SHC1P29353 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHC1P29353 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHC1P29353 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHC1P29353 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHC1P29353 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHC1P29353 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHC1P29353 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHC1P29353 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHC1P29353 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHC1P29353 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHC1P29353 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHC1P29353 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHC1P29353 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHC1P29353 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHC1P29353 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHC1P29353 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms