Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms