Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD34P28906 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD34P28906 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD34P28906 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD34P28906 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CD34P28906 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD34P28906 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD34P28906 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD34P28906 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD34P28906 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD34P28906 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD34P28906 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD34P28906 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD34P28906 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD34P28906 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD34P28906 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD34P28906 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD34P28906 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD34P28906 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD34P28906 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD34P28906 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD34P28906 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD34P28906 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD34P28906 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD34P28906 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD34P28906 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD34P28906 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD34P28906 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD34P28906 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD34P28906 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD34P28906 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD34P28906 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD34P28906 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CD34P28906 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD34P28906 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD34P28906 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD34P28906 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD34P28906 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD34P28906 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD34P28906 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD34P28906 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD34P28906 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD34P28906 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD34P28906 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD34P28906 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CD34P28906 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD34P28906 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CD34P28906 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CD34P28906 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CD34P28906 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD34P28906 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD34P28906 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CD34P28906 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD34P28906 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD34P28906 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD34P28906 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD34P28906 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD34P28906 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD34P28906 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD34P28906 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD34P28906 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD34P28906 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD34P28906 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD34P28906 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD34P28906 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD34P28906 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CD34P28906 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD34P28906 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD34P28906 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD34P28906 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD34P28906 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD34P28906 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CD34P28906 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD34P28906 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD34P28906 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD34P28906 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD34P28906 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CD34P28906 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD34P28906 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CD34P28906 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD34P28906 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CD34P28906 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CD34P28906 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD34P28906 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CD34P28906 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CD34P28906 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD34P28906 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD34P28906 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD34P28906 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD34P28906 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD34P28906 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CD34P28906 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CD34P28906 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD34P28906 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD34P28906 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CD34P28906 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CD34P28906 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD34P28906 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD34P28906 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD34P28906 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms