Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMGB2P26583 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMGB2P26583 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms