Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms