Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRHP20396 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TRHP20396 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRHP20396 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TRHP20396 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRHP20396 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRHP20396 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRHP20396 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRHP20396 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRHP20396 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRHP20396 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TRHP20396 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRHP20396 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRHP20396 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRHP20396 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRHP20396 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRHP20396 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRHP20396 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRHP20396 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRHP20396 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TRHP20396 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRHP20396 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRHP20396 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRHP20396 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRHP20396 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRHP20396 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRHP20396 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRHP20396 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRHP20396 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRHP20396 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRHP20396 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRHP20396 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRHP20396 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRHP20396 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRHP20396 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRHP20396 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRHP20396 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRHP20396 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRHP20396 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRHP20396 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRHP20396 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRHP20396 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRHP20396 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRHP20396 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TRHP20396 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRHP20396 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TRHP20396 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRHP20396 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TRHP20396 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRHP20396 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRHP20396 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRHP20396 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TRHP20396 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TRHP20396 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRHP20396 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRHP20396 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRHP20396 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TRHP20396 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRHP20396 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRHP20396 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRHP20396 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRHP20396 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRHP20396 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRHP20396 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRHP20396 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TRHP20396 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRHP20396 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRHP20396 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRHP20396 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRHP20396 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRHP20396 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRHP20396 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TRHP20396 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRHP20396 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRHP20396 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRHP20396 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRHP20396 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRHP20396 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRHP20396 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TRHP20396 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRHP20396 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRHP20396 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRHP20396 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRHP20396 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRHP20396 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRHP20396 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRHP20396 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TRHP20396 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRHP20396 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRHP20396 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TRHP20396 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TRHP20396 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRHP20396 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRHP20396 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRHP20396 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRHP20396 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRHP20396 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRHP20396 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRHP20396 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRHP20396 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
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