Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRF1P14222 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRF1P14222 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRF1P14222 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRF1P14222 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRF1P14222 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRF1P14222 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRF1P14222 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRF1P14222 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRF1P14222 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRF1P14222 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRF1P14222 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRF1P14222 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRF1P14222 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRF1P14222 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRF1P14222 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRF1P14222 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRF1P14222 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRF1P14222 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRF1P14222 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRF1P14222 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRF1P14222 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRF1P14222 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRF1P14222 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRF1P14222 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRF1P14222 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRF1P14222 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRF1P14222 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRF1P14222 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRF1P14222 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRF1P14222 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRF1P14222 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRF1P14222 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRF1P14222 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRF1P14222 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRF1P14222 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRF1P14222 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRF1P14222 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRF1P14222 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRF1P14222 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRF1P14222 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRF1P14222 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRF1P14222 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRF1P14222 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRF1P14222 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRF1P14222 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRF1P14222 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRF1P14222 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRF1P14222 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRF1P14222 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRF1P14222 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRF1P14222 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRF1P14222 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRF1P14222 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRF1P14222 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRF1P14222 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRF1P14222 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRF1P14222 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PRF1P14222 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRF1P14222 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRF1P14222 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRF1P14222 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRF1P14222 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PRF1P14222 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRF1P14222 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRF1P14222 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRF1P14222 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRF1P14222 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRF1P14222 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRF1P14222 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRF1P14222 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRF1P14222 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRF1P14222 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRF1P14222 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRF1P14222 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRF1P14222 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PRF1P14222 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRF1P14222 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRF1P14222 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRF1P14222 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRF1P14222 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRF1P14222 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRF1P14222 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRF1P14222 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRF1P14222 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRF1P14222 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRF1P14222 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRF1P14222 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRF1P14222 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRF1P14222 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRF1P14222 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRF1P14222 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRF1P14222 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRF1P14222 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRF1P14222 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRF1P14222 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRF1P14222 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRF1P14222 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRF1P14222 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRF1P14222 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms