Protein–RNA interactions for Protein: P12644

BMP4, Bone morphogenetic protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4P12644 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BMP4P12644 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BMP4P12644 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BMP4P12644 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BMP4P12644 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BMP4P12644 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BMP4P12644 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BMP4P12644 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BMP4P12644 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BMP4P12644 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BMP4P12644 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BMP4P12644 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BMP4P12644 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BMP4P12644 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BMP4P12644 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BMP4P12644 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BMP4P12644 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BMP4P12644 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BMP4P12644 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BMP4P12644 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BMP4P12644 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BMP4P12644 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BMP4P12644 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BMP4P12644 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BMP4P12644 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BMP4P12644 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BMP4P12644 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BMP4P12644 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BMP4P12644 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BMP4P12644 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BMP4P12644 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BMP4P12644 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BMP4P12644 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BMP4P12644 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BMP4P12644 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BMP4P12644 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BMP4P12644 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BMP4P12644 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BMP4P12644 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BMP4P12644 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BMP4P12644 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BMP4P12644 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BMP4P12644 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BMP4P12644 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BMP4P12644 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BMP4P12644 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BMP4P12644 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BMP4P12644 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BMP4P12644 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BMP4P12644 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BMP4P12644 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BMP4P12644 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BMP4P12644 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BMP4P12644 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BMP4P12644 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BMP4P12644 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BMP4P12644 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BMP4P12644 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BMP4P12644 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BMP4P12644 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BMP4P12644 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BMP4P12644 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BMP4P12644 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BMP4P12644 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BMP4P12644 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BMP4P12644 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BMP4P12644 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BMP4P12644 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BMP4P12644 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BMP4P12644 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BMP4P12644 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BMP4P12644 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BMP4P12644 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BMP4P12644 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BMP4P12644 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BMP4P12644 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BMP4P12644 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BMP4P12644 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BMP4P12644 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BMP4P12644 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BMP4P12644 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BMP4P12644 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BMP4P12644 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BMP4P12644 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BMP4P12644 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BMP4P12644 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BMP4P12644 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BMP4P12644 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BMP4P12644 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BMP4P12644 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BMP4P12644 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BMP4P12644 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BMP4P12644 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BMP4P12644 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BMP4P12644 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BMP4P12644 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BMP4P12644 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BMP4P12644 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BMP4P12644 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BMP4P12644 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms