Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms