Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL3P10147 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL3P10147 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL3P10147 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL3P10147 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL3P10147 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL3P10147 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL3P10147 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL3P10147 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL3P10147 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL3P10147 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL3P10147 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL3P10147 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL3P10147 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL3P10147 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL3P10147 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL3P10147 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL3P10147 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL3P10147 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL3P10147 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL3P10147 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL3P10147 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL3P10147 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL3P10147 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL3P10147 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL3P10147 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL3P10147 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL3P10147 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL3P10147 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL3P10147 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL3P10147 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL3P10147 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL3P10147 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL3P10147 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL3P10147 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL3P10147 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL3P10147 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL3P10147 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL3P10147 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL3P10147 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL3P10147 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL3P10147 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL3P10147 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL3P10147 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL3P10147 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL3P10147 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL3P10147 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL3P10147 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL3P10147 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL3P10147 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL3P10147 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL3P10147 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL3P10147 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL3P10147 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL3P10147 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL3P10147 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL3P10147 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL3P10147 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL3P10147 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL3P10147 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL3P10147 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL3P10147 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL3P10147 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL3P10147 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL3P10147 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL3P10147 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL3P10147 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL3P10147 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL3P10147 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL3P10147 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL3P10147 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL3P10147 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL3P10147 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL3P10147 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL3P10147 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL3P10147 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL3P10147 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL3P10147 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL3P10147 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL3P10147 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL3P10147 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL3P10147 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL3P10147 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL3P10147 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL3P10147 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL3P10147 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL3P10147 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL3P10147 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL3P10147 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL3P10147 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL3P10147 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL3P10147 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL3P10147 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL3P10147 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL3P10147 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL3P10147 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL3P10147 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL3P10147 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL3P10147 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL3P10147 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms