Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PKHD1P08F94 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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