Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA1P02647 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA1P02647 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA1P02647 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA1P02647 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA1P02647 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA1P02647 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA1P02647 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA1P02647 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA1P02647 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA1P02647 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA1P02647 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA1P02647 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA1P02647 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA1P02647 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA1P02647 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA1P02647 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA1P02647 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA1P02647 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA1P02647 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA1P02647 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA1P02647 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA1P02647 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA1P02647 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA1P02647 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA1P02647 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA1P02647 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA1P02647 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA1P02647 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA1P02647 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA1P02647 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA1P02647 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA1P02647 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA1P02647 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA1P02647 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA1P02647 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA1P02647 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA1P02647 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA1P02647 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA1P02647 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA1P02647 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA1P02647 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOA1P02647 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOA1P02647 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOA1P02647 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOA1P02647 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOA1P02647 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOA1P02647 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOA1P02647 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOA1P02647 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOA1P02647 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOA1P02647 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOA1P02647 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOA1P02647 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOA1P02647 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOA1P02647 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOA1P02647 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOA1P02647 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOA1P02647 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOA1P02647 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOA1P02647 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOA1P02647 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
APOA1P02647 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOA1P02647 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOA1P02647 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOA1P02647 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOA1P02647 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOA1P02647 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOA1P02647 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOA1P02647 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOA1P02647 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
APOA1P02647 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOA1P02647 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOA1P02647 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOA1P02647 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOA1P02647 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOA1P02647 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOA1P02647 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOA1P02647 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOA1P02647 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOA1P02647 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOA1P02647 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOA1P02647 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOA1P02647 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOA1P02647 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOA1P02647 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOA1P02647 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOA1P02647 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOA1P02647 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOA1P02647 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOA1P02647 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOA1P02647 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
APOA1P02647 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOA1P02647 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOA1P02647 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOA1P02647 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOA1P02647 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOA1P02647 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
APOA1P02647 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOA1P02647 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms