Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GMDSO60547 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GMDSO60547 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GMDSO60547 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GMDSO60547 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GMDSO60547 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GMDSO60547 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GMDSO60547 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GMDSO60547 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GMDSO60547 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GMDSO60547 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GMDSO60547 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GMDSO60547 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GMDSO60547 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GMDSO60547 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GMDSO60547 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GMDSO60547 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GMDSO60547 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GMDSO60547 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GMDSO60547 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GMDSO60547 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GMDSO60547 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GMDSO60547 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GMDSO60547 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GMDSO60547 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GMDSO60547 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GMDSO60547 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GMDSO60547 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GMDSO60547 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GMDSO60547 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GMDSO60547 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GMDSO60547 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GMDSO60547 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GMDSO60547 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GMDSO60547 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GMDSO60547 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GMDSO60547 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GMDSO60547 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GMDSO60547 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GMDSO60547 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GMDSO60547 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GMDSO60547 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GMDSO60547 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GMDSO60547 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GMDSO60547 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GMDSO60547 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GMDSO60547 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GMDSO60547 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GMDSO60547 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GMDSO60547 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GMDSO60547 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GMDSO60547 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GMDSO60547 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GMDSO60547 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GMDSO60547 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GMDSO60547 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GMDSO60547 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GMDSO60547 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GMDSO60547 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GMDSO60547 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GMDSO60547 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GMDSO60547 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GMDSO60547 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GMDSO60547 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GMDSO60547 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GMDSO60547 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GMDSO60547 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GMDSO60547 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GMDSO60547 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GMDSO60547 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GMDSO60547 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GMDSO60547 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GMDSO60547 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GMDSO60547 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GMDSO60547 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GMDSO60547 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GMDSO60547 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GMDSO60547 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GMDSO60547 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GMDSO60547 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GMDSO60547 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GMDSO60547 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GMDSO60547 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GMDSO60547 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GMDSO60547 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GMDSO60547 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GMDSO60547 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GMDSO60547 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GMDSO60547 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GMDSO60547 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GMDSO60547 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GMDSO60547 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GMDSO60547 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GMDSO60547 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GMDSO60547 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GMDSO60547 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GMDSO60547 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GMDSO60547 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GMDSO60547 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GMDSO60547 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms