Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EDIL3O43854 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms