Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms